30 августа 1703 года через три месяца после закладки Санкт-Петербурга, в городе произошло наводнение. Оно стало первым в северной столице, открыв историю затоплений города, которые с тех пор происходили практически ежегодно.
Наводнения в устье Невы случались и до основания Петербурга. Судя по шведским летописям, самым крупным из них стало наводнение 1691 года, в результате которого под водой оказалась вся местность центральной части будущего города на двадцать пять футов высоты (7,62 метра).
За всю свою историю Санкт-Петербург около трехсот раз становился жертвой катастрофических наводнений, которые происходили практически ежегодно. В большинстве случаев удар стихии обрушивался на северную столицу в конце осени. Впервое жителям города столкнуться с наводнением пришлось почти сразу после его закладки в 1703 году — 30 августа за считанные часы вода неожиданно поднялась поднялась на целых 2 метра, затопив все вокруг.
Поскольку бедствие случалось регулярно, власти всегда пытались предупредить петербуржцев о надвигающейся опасности. В 1721 году Петр I издал Указ, гласивший: «Как вода начнет прибывать, то весь рогатый скот и лошадей отсылать в лес». Екатерина II велела отмечать уровень воды, а дома строить на фут выше.
В случае наводнения людей оповещали пушечными выстрелами из Подзорного дома, Галерной гавани, Адмиралтейства, а также барабанным боем, звоном колоколов. На шпицах вывешивались красные флаги днем и фонари ночью. В 1897 году была создана «Служба предупреждения наводнений на Неве» при Главной физической обсерватории. Ученые установили, что наводнения связаны с циклонами, ветры которых сгоняют балтийскую воду к «горлу» Финского залива, образуя незаметную вначале волну. Когда эта волна начинает двигаться к берегу и выходит на мелководье, ее высота начинает быстро расти. Уровень воды в Неве стремительно поднимается, и в город приходит очередное наводнение.
Наиболее катастрофические наводнения случились в городе в 1777, 1824 и 1924 годах. Во время первого вода уничтожила все фонтаны Летнего сада и многие деревянные дома. Второе наводнение описал Александр Пушкин в своем «Медном всаднике». А в сентябре 1924 года река затопила Летний сад, Дворцовую и Исаакиевскую набережные, Марсово поле, прилегающие к ним улицы и переулки. Под водой оказались Васильевский остров, Петроградская сторона, почти весь центр города. Потери были огромны: вода снесла 19 мостов, повредила более 5000 домов, много людей погибло.